Η επέμβαση γίνεται σε μία ειδικά διαμορφωμένη αίθουσα LASER στα εξωτερικά ιατρεία του Νοσοκομείου (όχι σε χειρουργείο).
Περιμένοντας στην αίθουσα αναμονής η νοσοκόμα βάζει αρκετές αναισθητικές σταγόνες και στα δύο μάτια. Έπειτα ο ασθενής περνά στην αίθουσα του LASER, όπου ξαπλώνει σε ειδική καρέκλα (τύπου οδοντιατρείου) κεκλιμένη προς τα πίσω. Τα μάτια καθαρίζονται, απολυμαίνονται, και όλο το κεφάλι καλύπτεται με ειδικό αποστειρωμένο κάλυμμα μίας χρήσης. Και άλλες σταγόνες αναισθητικές ενσταλάζονται στο μάτι, και τοποθετείται ένας ειδικός βλεφαροδιαστολέας που κρατά τα βλέφαρα ανοικτά, ενώ ακριβώς πάνω από το μάτι υπάρχει η έξοδος του LASER (περίπου σαν βιντεοκάμερα) με ένα οδηγό-φως για να προσηλώνει ο ασθενής το βλέμμα του.
Κατ΄αρχάς με ένα ειδικό μαρκαδόρο σημειώνονται κάποια οδηγά σημεία στην επιφάνεια του κερατοειδούς, και μετά το δακτυλίδι αναρρόφησης επικάθεται στον κερατοειδή και με αρνητική πίεση προσκολλάται επάνω του. Το δακτυλίδι αναρρόφησης ρουφά και επιπεδώνει την επιφάνεια του κερατοειδούς που πρόκειται να δεχθεί το LASER.
Πάνω στον δακτύλιο αυτό τοποθετείται και κουμπώνει ο μικροκερατοτόμος, ένα ειδικό αυτόματο ρομποτικό εργαλείο το οποίο κινείται αυτομάτως επάνω από τον κερατοειδή σε μία προκαθορισμένη τροχιά προς τα εμπρός και πάλι επιστρέφει προς πίσω, δημιουργώντας έτσι ένα μικρό κερατικό κρημνό (μία φλίδα πάρα πολύ λεπτή) η οποία ενώνεται με τον υπόλοιπο κερατοειδή με ένα μικρό μίσχο στην άκρη. Αφού δημιουργηθεί ο κρημνός, ο μικροκερατοτόμος και το δακτυλίδι αναρρόφησης απομακρύνονται από το μάτι, και ο κρημνός ανασπάτε προς τα πίσω αφήνοντας εκτεθειμένο το τμήμα (στρώμα) του κερατοειδούς το οποίο θα δεχθεί το LASER ο εκτεθειμένος κερατοειδής στεγνώνετε και το LASER επικεντρώνεται στο κέντρο της κόρης του ματιού.
Κατόπιν ακολουθούν 30-60 δευτερόλεπτα LASER, τα οποία ο ασθενής ουσιαστικά αντιλαμβάνεται σαν λάμψη που βλέπει μπροστά από το μάτι του. Στην πραγματικότητα αυτό που κάνει το LASER είναι να εξατμίζει με ακρίβεια και σε προκαθορισμένο βάθος κύτταρα από το στρώμα του κερατοειδούς, επιπεδώνοντας (σμιλεύοντας) την επιφάνεια του.
Αφού τελειώσει και η διαδικασία του LASER ο κρημνός τοποθετείται ξανά και κλείνει στην θέση που ήταν πριν. Ο χειρουργός βεβαιώνεται ότι ο κρημνός έχει επικαθίσει ομαλά επάνω στο στρώμα του κερατοειδούς, όλος ο κερατοειδής ελέγχεται αρκετές φορές όσον αφορά την αρχιτεκτονική του τελειότητα, στεγνώνετε, τοποθετούνται αρκετές αντιβιοτικές σταγόνες, αφαιρείται ο βλεφαροδιαστολέας και η ίδια ακριβώς διαδικασία ακολουθείται και για το άλλο μάτι.
Η όλη διαδικασία είναι ανώδυνη και η μόνη ενόχληση που μπορεί να έχει κανείς είναι μία μικρή αρχική δυσφορία που μπορεί να νιώθει λόγω του βλεφαροδιαστολέα ή όταν επικάθεται το δακτυλίδι αναρρόφησης όπου συνήθως για μερικά δευτερόλεπτα υπάρχει και απώλεια του φωτός, που επανέρχεται μετά την αφαίρεση του δακτυλιδιού.